Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Mbd3Q9Z2D8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms