Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VarsQ9Z1Q9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms