Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lgr5Q9Z1P4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms