Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setbp1Q9Z180 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Setbp1Q9Z180 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms