Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cog1Q9Z160 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms