Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms