Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma4Q9R1P0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms