Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NrkQ9R0G8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NrkQ9R0G8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NrkQ9R0G8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NrkQ9R0G8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms