Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms