Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf4Q9QZS2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf4Q9QZS2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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