Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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