Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ercc4Q9QZD4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ercc4Q9QZD4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms