Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps29Q9QZ88 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vps29Q9QZ88 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms