Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snai3Q9QY31 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms