Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kcnip3Q9QXT8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Kcnip3Q9QXT8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms