Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrfQ9JM73 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SrfQ9JM73 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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