Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms