Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Bco1Q9JJS6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bco1Q9JJS6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Bco1Q9JJS6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Bco1Q9JJS6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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