Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms