Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms