Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr3bQ9JHJ5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms