Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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