Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ush1cQ9ES64 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms