Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn2Q9ER65 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn2Q9ER65 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms