Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx12Q9ER00 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms