Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rapgef4Q9EQZ6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rapgef4Q9EQZ6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rapgef4Q9EQZ6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rapgef4Q9EQZ6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rapgef4Q9EQZ6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rapgef4Q9EQZ6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms