Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms