Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rnft1Q9DCN7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms