Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms