Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph3bQ9DA80 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms