Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmco5aQ9D9D5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms