Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8Q6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms