Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp4cQ9D7F7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms