Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Srp19Q9D7A6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Srp19Q9D7A6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms