Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms