Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gcc1Q9D4H2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms