Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam90a1bQ9D4F3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam90a1bQ9D4F3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms