Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rsph14Q9D3W1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms