Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Fndc8Q9D2H8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc8Q9D2H8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms