Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl28Q9D1B9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms