Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syf2Q9D198 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syf2Q9D198 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms