Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc47Q9D024 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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