Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc77Q9CZH8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc77Q9CZH8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms