Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sgo1Q9CXH7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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