Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930535I16RikQ9CUI2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930535I16RikQ9CUI2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms