Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CR55 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CR55 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CR55 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Q9CR55 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CR55 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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