Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska2Q9CR46 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms