Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms