Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubl4bQ9CQ84 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms