Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ssxb1Q9CPU1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ssxb1Q9CPU1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ssxb1Q9CPU1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ssxb1Q9CPU1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ssxb1Q9CPU1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssxb1Q9CPU1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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